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Inicio Aplicaciones en Alhambra Área de Biología

Área de Biología

Pulse sobre el nombre de la aplicación que quiera usar para ver las instrucciones de ejecución.

NombreDescripción
AMBERConjunto de aplicaciones orientadas a cálculos de mecánica y dinámica molecular de proteínas y ácidos nucléicos.
BLASRAplicación para realizar alineamiento de secuencias de proteínas
BLASTAplicación que permite realizar alineamientos de secuencias de proteínas y ácidos nucleicos.
BioPerlConjunto de aplicaciones en PERL de utilidad en Biología.
CP2KAplicación para realizar simulaciones a nivel atómico y molecular de sistemas en estado sólido, líquidos, moleculares y biológicos
ClustalWPrograma para alineamiento múltiple de secuencias
DOCKDocking de proteínas y ácidos nucleicos.
DesmondPaquete software para simulaciones de dinámica molecular de sistemas biológicos
ExaMLCódigo en MPI para el cálculo de la máxima verosimilitud para arquitecturas exaescalares (Exascale Maximum Likelihood) para inferencia filogenética
GROMACSSimulaciones de dinámica molecular de proteinas y ácido nucleicos.
HMMERImplementación de métodos HMM (modelos ocultos de Márkov) para análisis de secuencias biológicas
LAMMPSPrograma de dinámica molecular
MrBayesUna aplicación filogenética de determinación de la similitud evolutiva de varias especies.
NAMDAplicación orientada a dinámica molecular de proteínas y ácidos nucléicos.
NWChemPrograma para realizar cálculos Ab-Initio de moléculas y sólidos, así como dinámica molecular.
PhyMLPaquete software para estimar filogenias de máxima verosimilitud a partir de alineamientos de secuencias de nucleótidos o aminoácidos
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