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Inicio Aplicaciones en Alhambra Área de Química

Área de Química

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NombreDescripción
ABINITUna aplicación destinada a cálculos DFT usando pseudopotenciales orientada al estudio de sistemas periódicos.
ACES IIIUn progama de cálculo mecanocuántico especializado en métodos perturbativos \\\"Coupled Cluster\\\"
AMBERConjunto de aplicaciones orientadas a cálculos de mecánica y dinámica molecular de proteínas y ácidos nucléicos.
BLASTAplicación que permite realizar alineamientos de secuencias de proteínas y ácidos nucleicos.
CP2KAplicación para realizar simulaciones a nivel atómico y molecular de sistemas en estado sólido, líquidos, moleculares y biológicos
CPMDPrograma orientado a dinámica molecular ab-initio usando el método Car-Parrinello.
CSDBase de datos que contiene la estructuras cristalográficas de compuestos orgánicos y organometálicos.
DOCKDocking de proteínas y ácidos nucleicos.
GAMESSCálculo Ab-Initio de moléculas.
GAUSSIANQuímica cuántica (ab-initio HF, DFT)
GROMACSSimulaciones de dinámica molecular de proteinas y ácido nucleicos.
HMMERImplementación de métodos HMM (modelos ocultos de Márkov) para análisis de secuencias biológicas
LAMMPSPrograma de dinámica molecular
MrBayesUna aplicación filogenética de determinación de la similitud evolutiva de varias especies.
NAMDAplicación orientada a dinámica molecular de proteínas y ácidos nucléicos.
NWChemPrograma para realizar cálculos Ab-Initio de moléculas y sólidos, así como dinámica molecular.
Quantum EspressoPrograma de cálculo de estructuras cristalinas basado en ondas planas.
SIESTASIESTA (Spanish Initiative for Electronic Simulations with Thousand of Atoms) se refiere a un método y a su implementación en un programa, para realizar cálculos de estructura electrónica y dinámica molecular.
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