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Aplicaciones en Alhambra

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NombreDescripción
ABINITUna aplicación destinada a cálculos DFT usando pseudopotenciales orientada al estudio de sistemas periódicos.
AMBERConjunto de aplicaciones orientadas a cálculos de mecánica y dinámica molecular de proteínas y ácidos nucléicos.
ATLASImplementación eficiente y portable de la biblioteca BLAS y de ciertas funciones de la biblioteca LAPACK
BLACSLas liberias BLACS incorporan rutinas de algebra lineal (Basic Linear Algebra Communication Subprograms) orientadas para el uso de paso de mensajes (MPI) a la hora de desarrollar aplicaciones de algebra lineal.
BLASBiblioteca con funciones para realizar operaciones básicas con vectores y matrices
BioPerlConjunto de aplicaciones en PERL de utilidad en Biología.
BlenderPrograma para modelado, animación y creación de gráficos.
BoostConjunto de bibliotecas para extender la funcionalidad de C++
CP2KAplicación para realizar simulaciones a nivel atómico y molecular de sistemas en estado sólido, líquidos, moleculares y biológicos
CPMDPrograma orientado a dinámica molecular ab-initio usando el método Car-Parrinello.
CSDBase de datos que contiene la estructuras cristalográficas de compuestos orgánicos y organometálicos.
CUDACompilador y conjunto de herramientas para programación de GPU
DesmondPaquete software para simulaciones de dinámica molecular de sistemas biológicos
F2CTranscompilador para convertir código Fortran 77 en código C
FFTWLibrería de subrutinas en C para el cálculo de la transformada de Fourier rápida
G95Compilador de Fortan 95 con varias optimizaciones e innovaciones, entre ellas Co-Array Fortran
GAMESSCálculo Ab-Initio de moléculas.
GAPSistema para álgebra computacional discreta, con énfasis especial en la Teoría de Grupos Computacional
GAUSSIANQuímica cuántica (ab-initio HF, DFT)
GCCCompilador del proyecto GNU
GMPBiblioteca matemática para operaciones de precisión arbitraria
GotoBLAS2Implementación optimizada de la biblioteca BLAS
HDF5Formato de archivo y biblioteca para datos científicos
Intel CompilerCompilador de C/C++/Fortran optimizado para arquitecturas Intel
Intel MKLBiblioteca de rutinas matemáticas optimizadas para ciencia, ingeniería y aplicaciones financieras
JavaPlataforma software para desarrollar aplicaciones multiplataforma
LAMMPSPrograma de dinámica molecular
LAPACKBiblioteca en Fortran 90 para álgebra lineal
MPCBiblioteca C para aritmética con números complejos de gran precisión
MPFRBiblioteca C para operaciones de múltiple precisión en coma flotante
MPIAPI para programación paralela con el modelo de memoria distrubuida para C/C++ y Fortran
ModulesPaquete para modificar de forma dinámica y sencilla el entorno de usuario
NAMDAplicación orientada a dinámica molecular de proteínas y ácidos nucléicos.
NWChemPrograma para realizar cálculos Ab-Initio de moléculas y sólidos, así como dinámica molecular.
NetCDFBiblioteca para acceso a datos en arrays para C, Fortran, C++, Java y otros lenguajes
OctaveOctave es un programa libre para realizar cálculos numéricos orientado al análisis numérico.
Quantum EspressoPrograma de cálculo de estructuras cristalinas basado en ondas planas.
REntorno para cálculo y generación de gráficos estadísticos
RubyLenguaje de programación interpretado, reflexivo y orientado a objetos
SIESTASIESTA (Spanish Initiative for Electronic Simulations with Thousand of Atoms) se refiere a un método y a su implementación en un programa, para realizar cálculos de estructura electrónica y dinámica molecular.
ScaLAPACKSubconjunto de la biblioteca LAPACK diseñada para entornos de memoria distribuida
WRFWRF (Weather Research and Forecast) es un sistema de predicción meteorológica de mesoescala adecudo tanto para la predicción como para la investigación meteorológica
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